梅雨前線や低気圧の影響で、１２日は西日本や東北を中心に雨が降った。これまでの記録的大雨で地盤が緩んでいる地域では、少しの雨でも災害の危険度が高まっている。気象庁は同日、引き続き土砂災害、河川の増水や氾濫、低地の浸水に厳重な警戒を呼び掛けた。
１２日午前の１時間雨量は、長崎県新上五島町で３６・５ミリ、岩手県遠野市で３２・５ミリの激しい雨。熊本県山都町は２９・０ミリの強い雨となった。
気象庁によると、梅雨前線は西日本や東日本を通り日本の東に延びている。秋田沖の低気圧は東北に接近。前線は１２日夜にかけて、東日本を南下するが、九州付近では停滞する見込みだ。１３日には別の低気圧が黄海から日本海を東に進み、前線が再び北上する。前線や低気圧に暖かく湿った空気が流れ込み、大気の状態が非常に不安定になりそうだ。
１３日正午までの２４時間予想雨量は、九州北部１２０ミリ、九州南部、中国、関東甲信５０ミリ、北陸、東海、東北４０ミリ、四国３０ミリなど。
