停滞する梅雨前線の影響で九州で猛烈な雨が降り、熊本県八代市は市内全域の約５万６４００世帯、約１２万６５００人に避難指示を出した。熊本、鹿児島両県の避難指示対象は計１１市町村、計約９万２２００世帯、計約２０万３２００人になった。
熊本県では芦北町などで家が流されるなどして約１０人と連絡が取れなくなった。九州電力によると、熊本県内で４日午前１０時現在、大雨の影響で約８８４０戸が停電している。
気象庁のレーダー観測では熊本県を中心に線状降水帯のような強い降水域が確認された。同県天草市では１時間に９８ミリの猛烈な雨を記録し、観測史上１位の記録を更新。同県水俣市では降り始めからの総降水量が５００ミリに達し、宮崎県西米良村で２４時間降水量が３８０ミリ、鹿児島県さつま町で３００ミリを超えた。
